无毒的EB替代物gelred?怎么实验确定无毒?gelred使用后怎么处理?
身为生物专业实验员的硕士研究生,博士研究生用的最多的是电泳时还是使用EB。近来很多生物公司推销有无毒的EB替代物某某red,为什么说卖的替代物就无毒呢?某公司技术支持除了强调该产品真对人体无毒外,没说出来什么别的东西。有材料称,如果产品是可以完全代替EB而又无毒的话,你就必须具备以下几点指标:
1.艾姆斯氏试验以证明染料无诱变性
2.手套及皮肤的无渗透性实验
3.对DNA及RNA的迁移率实验
4.敏感性实验证明其染色效率
5.是否可降解及其对环境的影响
6.活细胞的穿透性
现在市场上可以说号称无毒的EB替代物有些泛滥,主流有以下几种:
一。GelRed 或GelGreen
GelRed 和 GelGreen 是两种集高灵敏、低毒性和超稳定于一身的极佳的荧光核酸凝胶染色试剂。其水溶染色剂通过美国环保局安全认定,废弃物可直接倒入下水道,而不会造成任何环境污染。
特性:
1.高灵敏度
GelRed 和 GelGreen 是目前市场中最灵敏的凝胶核酸染料
2.稳定性极好
可以使用微波炉加热,可以在室温下保存,不易挥发。
3.更安全
艾姆斯氏试验结果表明,该染料的诱变性远小于溴化乙锭 ( EB )(请注意不是没有,所以还是要戴手套。)
4.广泛的适应性
适用于预制凝胶和凝胶电泳后染色
5.染色过程简单
与 EB 一样,在预制胶和电泳过程中不必担心染料降解;而电泳后染色过程也只需 30 分钟且无需脱色或冲洗
6.对 DNA 和 RNA 的迁移影响极小
对核酸迁移的影响小于 SYBR Green I
与标准凝胶成像系统以及可见光激发的凝胶观察装置完美兼容
使用 312nm 激发的 UV 凝胶成像系统时, GelRed 可以完美的替代 EB ;使用 254nm 激发的 UV 凝胶成像系统或可见光激发的凝胶观察装置时, GelGreen 足以替代任意一种 SYBR 染料
以上是公司产品的介绍,以GelRed为例这种染料可用三种方法染色。1.前染法,2.后染法3.加入电泳液中。
前染法图
后染法图
这三种方法要比EB麻烦一些,但该染料的确不适合直接加到胶里面,否则图片不太好看,除此之外,过于灵敏也不是什么好事,以至于很多PCR产物在凝胶成像仪下根本分不出来浓度(都很亮)。再者,该染料会使小片段DNA迁移慢一些(与EB相比).
二。Goldview
该染料从质谱对比试验结果来看,该产品似乎就是AO(丫啶橙 ,一种剧毒产品)且荧光效果远不如EB.
三.SYBR Green
SYBR Green I是高灵敏的DNA荧光染料,适用于各种电泳分析,操作简单:无须脱色或冲洗。至少可检出20pg DNA,高于EB染色法25-100倍。
SYBR Green I 与dsDNA 结合荧光信号会增强800-1000倍,用SYBR Green I染色的凝胶样品荧光信号强,背景信号低。可适用于多种电泳分析。
首先它是属于花箐素类核酸染料,经常有经销商只提花箐素类核酸染料,不去提SYBR Green,必须指出的是花箐类染料不是无毒的,而只是低毒的,如果是想用这种染料,就必须买电泳级别的,电泳级别的是经过修饰的,修饰有三种:1.加入卤素或氰基。2.插入环羟基。3.加入稳定剂。否则就像我们采用SYBR Green进行荧光定量PCR,溶解曲线很好,但上电泳后看到的是弥散的现象,因为这种SYBR Green并没有修饰(降低成本)在电泳过程中反复与DNA结合脱离所造成的。
由于溴化乙锭和花箐素类核酸染料具有一定的毒性,实验结束后,应对含EB的溶液进行净化处理再行弃置,以避免污染环境和危害人体健康。
(1) 对于EB含量大于0.5mg/ml的溶液,可如下处理:
①将EB溶液用水稀释至浓度低于0.5mg/ml;
②加入一倍体积的0.5mol/L KMnO4,混匀,再加入等量的25mol/L HCl,混匀,置室温数小时;
③加入一倍体积的2.5mol/L NaOH,混匀并废弃。
(2) EB含量小于0.5mg/ml的溶液可如下处理:
① 按1mg/ml的量加入活性炭,不时轻摇混匀,室温放置1小时;
② 用滤纸过滤并将活性碳与滤纸密封后丢弃。
不管是什么品牌的染料,请尽量索取安全检验报告,如果没有的话凭什么说染料无毒呢?总要有安全实验结果证明才行吧,知识产权的保密和安全报告的公布是不冲突的。请大家记住,EB只是中毒毒性!EB早期是用来治疗人体寄生虫的(参考分子克隆)。箐素类核酸染料不是无毒,只是低毒。如果不确定的话,规范自己的操作的情况下EB还是没问题的。凡是实验都要戴手套操作,这样才能加强安全,有了安全意识比什么都重要。